基因元素vi设计(基因元素组成)
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基因表达的主成分分析图怎么分析
基因表达数据分析主成分分析 ( Princ ipal Component Analysis , PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m 个观察值,形成一个 n ′ m 的数据矩阵, n 通常比较大。对于一个由多个变量描述的复杂事物,人们难以认识,那么是否可以抓住事物主要方面进行重点分析呢如果事物的主要方面刚好体现在几个主要变量上,我们只需要将这几个变量分离出来,进行详细分析。但是,在一般情况下,并不能直接找出这样的关键变量。这时我们可以用原有变量的线性组合来表示事物的主要方面, PCA 就是这样一种分析方法。PCA 的目标是寻找 r ( r
降到
。
在进行基因表达数据分析时,一个重要问题是确定每个实验数据是否是独立的,如果每次实验数据之间不是独立的,则会影响基因表达数据分析结果的准确性。对于利用基因芯片 所检测到的基因表达数据,如果用 PCA 方法进行分析,可以将各个基因作为变量,也可以将实验条件作为变量。当将基因作为变量时,通过分析确定一组“主要基因元素”,它们能够很好地说明基因的特征,解释实验现象;当将实验条件作为变量时,通过分析确定一组“主要实验因素”,它们能够很好地刻画实验条件的特征,解释基因的行为。下面着重考虑以实验条件作为变量的 PCA 分析方法。假设将数据的维数从 R N 降到 R 3 ,具体的 PCA 分析步骤如下:
(1) 第一步计算矩阵 X 的样本的协方差矩阵 S :
(2) 第二步计算协方差矩阵S的本征向量 e1,e2,…,eN的本征值
, i = 1,2,…,N 。本征值按大到小排序:
; (3)第三步投影数据到本征矢张成的空间之中,这些本征矢相应的本征值为
。现在数据可以在三维空间中展示为云状的点集。
对于 PCA ,确定新变量的个数 r 是一个两难的问题。我们的目标是减小 r ,如果 r 小,则数据的维数低,便于分析 ,同时也降低了噪声,但可能丢失一些有用的信息。究竟如何确定 r 呢这需要进一步分析每个主元素对信息的贡献。
令
代表第 i 个特征值,定义第 i 个主元素的贡献率为:
(8-45)
前 r 个主成分的累计贡献率为:
(8-46)
贡献率表示所定义的主成分在整个数据分析中承担的主要意义占多大的比重,当取前 r 个主成分来代替原来全部变量时,累计贡献率的大小反应了这种取代的可靠性,累计贡献率越大,可靠性越大;反之,则可靠性越小。一般要求累计贡献率达到 70% 以上。
经过 PCA 分析,一个多变量的复杂问题被简化为低维空间的简单问题。可以利用这种简化方法进行作图,形象地表示和分析复杂问题。在分析基因表达数据时,可以针对基因作图,也可以针对实验条件作图。前者称为 Q 分析,后者称为 R 分析。
表 8.1 是对酵母 6000 多个基因在 7 个时间点表达数据的 PCA 分析结果,每列数据代表主元素的系数。从表中可以看出,前两个主元素反应了 90% 以上( 76.9%+13.5% )的变化,而前三个主元素反应了 95% 以上的变化,因此取前两个主元素即可。 图 8.6 是对 7 个特征值的图示。
图 8.7 是前三个主元素系数变化图。第 1 个主元素代表各个基因表达加权平均,除第 1 个时间点外,其它所有系数都为正值( 见图 8.7(a) )。如果某个基因对应此主元素的值为较大的正数,则基因表达上调,如果此主元素的值为较大的负数,则基因表达下调。第 2 个主元素表示在时间序贯中基因表达的变化,除第 1 个时间点外,其它系数逐个增大( 见图 8.7(b) )。如果某个基因的表达量随时间不断增加,则此主元素的值为正;如果表达量随时间不断减小,则此主元素的值为负。第 3 个主元素系数变化曲线为抛物线形( 见图 8.7(c) )。
什么是食品包装设计?
食品包装设计是指为食品设计的包装,旨在保护食品、促进销售和提高消费者体验。它需要考虑到食品本身的性质、运输方式、储存条件以及消费者对包装外观和易用性的需求等方面,综合考虑各种因素来设计出最优的包装方案。
包装设计原则包括以下几点:
吸引消费者目光:包装要能够吸引消费者的目光,让产品在众多竞争对手中脱颖而出。
与品牌形象相符:包装设计应该与品牌形象相一致,以建立品牌认同感和忠诚度。
明确产品特点:包装设计应该明确突出产品的独特卖点,使消费者能够清晰地了解产品的特点。
考虑包装材料和成本:中汇设计认为包装设计不能只注重外观,还要考虑包装材料和成本,以确保生产和运输的经济效益。
具有功能性:包装设计应该具有功能性,方便消费者使用和储存产品。
VI设计的作用有哪些
VI即(Visual Identity),通译为视觉识别系统,是CIS系统最具传播力和感染力的部分。是将CI的非可视内容转化为静态的视觉识别符号,以无比丰富的多样的应用形式,在最为广泛的层面上,进行最直接的传播。设计到位、实施科学的视觉识别系统,是传播企业经营理念、建立企业知名度、塑造企业形象的快速便捷之途。“长在同一片沃土上的小草只能羡慕大树的伟岸,因为小草没有大树的基因”。著名品牌战略专家翁向东认为,品牌的命运很大程度上取决于品牌的基因,而品牌基因中重要的一项就是VI设计。优秀、识别性强的VI设计不仅大大降低品牌创建成本,更能为品牌注入大品牌的气质。因而VI设计不仅仅是一项艺术性工作,还要同时考虑到品牌战略,具有战略高度的VI设计才称得上优秀的VI设计。
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