内参actin(内参actin和gapdh)
大家好!今天让创意岭的小编来大家介绍下关于内参actin的问题,以下是小编对此问题的归纳整理,让我们一起来看看吧。
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本文目录:
一、western blot内参抗体actin为什么出了好几条带
首先要确定你的样品没有降解,基本上看带型可以确定,条带要干净,没有拖尾,其次是你的一抗,这个需要跟别个同学做的对比,这两个问题排除后主要就是你的抗体稀释度了,浓度过高,显影底物过强都会出现杂带,而杂带跟你每次操作包括洗脱的时间 孵育的时间的不同,都可能出现在不同的位置
二、RT-PCR是,内参是什么时候加入,作用是什么?谢谢
你说的应该是real
time
pcr吧,注意rt其实是逆转录reverse
transcription的缩写,和real
time一定要分开来。
常说的qpcr,qrt-pcr,都是通过实时(real
time)的方法,测定样品中某个模版的起始量ct值
但是呢,由于之前rna提取、反转等步骤,各个步骤存在不同的效率,ct值并无法真实反应样品中模版的绝对量,因此,需要一个内参来做为参考。
比方说,a基因的ct值,在a样品中是18,在b样品中是20,由于a
b样品存在rna质量等等一系列不同,你无法直接就判断这个基因在a样品中的表达量是b样品的4倍。
这时候,我们需要一个内参,假如内参ct值在a样品中是14,而在b样品中是15。由于内参的稳定性,在不同样品中被认为是表达量一致的,因此,a基因的在ab样品之间的-δδct值是1,也就是表达量为2倍的关系。
这里,我们可以知道内参的作用,即通过测量内参,可以在后面分析过程中将不同样品的起始量均一化。内参需要选择在不同样品中有稳定表达量的基因,这就是为什么内参经常选择看家基因的原因。以小鼠为例,常用的内参有actin
gapdh
hprt等等。
当然,现在的很多观点认为这些基因在不同组织中丰度也不同,例如gapdh,在线粒体含量高的组织中丰度高,很多人认为用基因组dna做内参会更加靠谱,当然这是后话了,选择gapdh无碍于现阶段的实验,如果觉得不靠谱,可以选择两个内参。
你所研究的物种,应该有人已经发表过相应的内参,直接上数据库搜就可以了。
原创内容,码字不易,万望采纳。
三、求助水稻的actin 内参基因引物
ACTIN在研究中被发现最不稳定 引物为:
Forward GAAGATCACTGCCTTGCTCC
Reverse CGATAACAGCTCCTCTTGGC
其他较好的水稻内参基因为:
18S rRNA
Forward ATGATAACTCGACGGATCGC
Reverse CTTGGATGTGGTAGCCGTTT
Glyceraldehyde-3-hosphate dehydrogenase
Forward GGGCTGCTAGCTTCAACATC
Reverse TTGATTGCAGCCTTGATCTG
Tubulin
Forward TACCGTGCCCTTACTGTTCC
Reverse CGGTGGAATGTCACAGACAC
出自一下文章:
《Normalization of reverse transcription quantitative-PCR with
housekeeping genes in rice》
你可以上网下载自己好好研究下
内参基因对于实时定量的结果非常重要 要慎重选择
四、请问内参β-actin在血细胞里面也有表达吗?特别是红细胞,里面有吗?
都表达,他们的基因都是组成型基因,每种组织都会表达。所以红细胞里面也有。
以上就是关于内参actin相关问题的回答。希望能帮到你,如有更多相关问题,您也可以联系我们的客服进行咨询,客服也会为您讲解更多精彩的知识和内容。
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