关联分析的意义(关联分析的意义和作用)
大家好!今天让创意岭的小编来大家介绍下关于关联分析的意义的问题,以下是小编对此问题的归纳整理,让我们一起来看看吧。
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本文目录:
一、2018-11-06 GWAS实战(七)plink 进阶之关联分析
这一节说的是association analysis 也是我们分析单标记回归得到的结果(P值)的一步,这一步的结果可以用来与我 第一讲 联合起来,形成一个闭环。跑跑标准流程。
Association analysis 可以有很多用处,比如:
我这了主要介绍一个Linear and logistic models
这个主要是可以加入协变量作为控制,很灵活,但是可能速度会慢一点
说明上说最基础的用法是这样:
但是这里我遇到一个问题
我bed bim fam 是不包含表型数据的,所以我要自己重新定义一个表型文件
我这里用quantitative traits作为例子
一般来说,就是自己设置一个文件
然后使用 --pheno 指定这个文件
总共三列
前两列是family and within-family IDs 第三列是表型
我这里用第一主成分作为表型
咱们来试试看
程序就是这么设定的
成功啦
生成一个文件 assoc.linear
这个就可以用来画图啦
画图回到一
这里我解释一下每一列的意义吧
这个我就简单介绍到这里
这里我还遇到一些实战的问题
比如有些数据,我算出来极显著,P值等于0 ,这样后面画图 ylim不能为无穷大,会产生问题,还有就是我的图莫名其妙变瘦了,很奇怪。
二、关联分析在数据挖掘中的作用?关联分析的实例有哪些?
啤酒与尿布的故事
三、请举例说明什么是数据挖掘的关联分析任务
关联析指两或事物间存定关联,其事物能通其事物进行预测.目挖掘隐藏数据间相互关系 数据挖掘基本任务关联(association)顺序序贯模型(sequencing)关联析指搜索事务数据库(trarisactional databases)所细节或事务,寻找重复现概率高模式或规则 ~
四、生物信息学中的连锁分析与关联分析有哪些区别和联系呢?
生物信息学,是一门综合学科。涉及到数学,生物学和计算机的内容。但在我看来,计算机的基础需要,但要求不是很高,关键是要有很好的生物学知识,包括遗传学的、生物化学的、发育生物学的、分子生物学的、植物生理学的知识等等,也就说需要达到这样的一个要求:在进行数据分析时,能对各种分析结果进行生物学的评价,并给出最优的分析策略。同时也应该有纯熟的数理基础,包括统计学的、拓扑学的,这样才能把待分析的问题转换成可计算的模型,最后能给出实现的程序。从个人来说,因为生物信息学是一个非常大的领域,所以,关键是要确定自己的研究方向。比如,以关联分析为方向的生物信息学,那么就要掌握好各种关联分析的统计分析方法,有很强的数据管理能力,足够好的序列分析能力(这是进行variation查找和分析的基础)。回到6年以前,如果决定在生物信息学上发展,那么我也许会做下面这些事情:首先,从最不重要的计算机这个方面来说:要掌握好bash等脚本语言,一般的linux问题都能很好的解决。熟练使用apache,mysql等基础软件工具,用joomla等CMS配置搭建网站。应该努力精通perl,bioperl,以基于此的各种分析工具,比如gbrowser,cmap等。足够好的c/c++语言能力,这是实现新算法的最高效语言。应该努力精通R语言,这是进行统计分析的基础工具。如果有机会,学学erlang这样一些函数式语言吧。
以上就是关于关联分析的意义相关问题的回答。希望能帮到你,如有更多相关问题,您也可以联系我们的客服进行咨询,客服也会为您讲解更多精彩的知识和内容。
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